协议离婚算正式离婚。我国离婚有协议离婚和诉讼离婚两种方式，两种离婚方式具有同等的效力，也就是说婚姻登记机关颁发的离婚证与的离婚判决书效力是一样的，所以双方办理了协议离婚的当然算正式离婚。
法律依据
《民法典》第一千零七十六条，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
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